Exercises de bio-informatique
Résultat sur le dosage de l’ADN par electrophorèse


Rappel du principe de l’électrophorèse et de son utilisation pour doser l’ADN
http://www.inrp.fr/Acces/biotic/biomol/techgen/html/electrop.htm#schema

L'objectif du dosage est de savoir combien de fragment on a obtenu pour ensuite passer au clonage et au séquençage.
Réponse :

BET = intercalant ADN qui rend visible les fragments sous UV.

Taille ADN actine = environ 1,1 kb (lecture de la position sur le gel).
Concentration = lecture de la fluorescence (intensité) : l'ADN d'actine a une intensité proche de la première bande du marqueur M qui correspond à environ 200 ng (voir ci-dessous). On a déposé 5 µl du mélange réactionnel après PCR donc on a 200/5 = 40 ng/µl d'ADN d'actine dans notre solution d'ADN amplifié. Soit au total 40*50*= 2 µg d'ADN d'actine en tout après amplification.

Marqueur M : on a en tout environ 50 kb en cumulant la taille des fragments sur le gel ( 0.83+0.95+1.37+1.71+1.9+2.03+3.53+4.27+4.95+5.15+21.2) donc si 50 kb = 500 ng alors la première bande de 21.2 correspond environ à 200 ng).