Exercises de bio-informatique

Exercice 1 : Analyse d'une séquence nucléotidique inconnue

 

Pour la séquence nucléotidique, il s'agit de répondre aux questions suivantes :

  • Peut on trouver des ressemblances avec des séquences déjà existantes dans les banques de données ?
  • Existe-il des informations pertinentes dans les bases de données spécialisées (génomiques, bibliogaphiques)?
  • La séquence contient-elle une partie codante et si oui peut on identifier la protéine correspondante ?
  • La séquence contient-elle des motifs ou signaux particuliers pouvant aider dans la compréhension de sa fonction et/ou de son expression ?

    Pour chaque étape, vous disposez dans le cours « analyse bioinformatique des séquences », des liens vers les sites proposant les logiciels dont vous aurez besoin et surtout d'un petit exercice corrigé permettent de vous familiariser avec l'emploi de chacun de ces logiciels. N'hésitez pas en cas de difficulté avec un logiciel  à vous replonger dans ces petits exercices d'application.