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4. - La manipulation des données 4.2 - Les formats 4.2.2 - Les formats liés aux banques [suite] > Format PROSITE La syntaxe d'un pattern PROSITE suit un certain nombre de règles : - lettres A-Z correspondant aux acides aminés (minuscules ou majuscules) - [] ambiguite inclusive EX: [ILVM] - {} ambiguite exclusive EX: {FWY} - X caractère positionnel indifférent - (n) répétition n fixe d'un sous-motif EX: [RD](2) - X(n,m) insertions min-max (insertion variable) EX: X(2,4) - < au début du pattern : le pattern est cadré à gauche de la séquence - > à la fin du pattern : le pattern est cadré à droite de la séquence - le caractère '-' sépare chaque position - le caractère '+' indique que la suite du pattern continue à la ligne suivante Exemples de motifs : C-{CPWHF}-X(2,4)-C-H-{CFYW} AXGHXXX[QST]{DR} [LIVM]-x(4)-[LIVM]-x(6,8)-Y-x(12,13)-[LIVM]-x(2)-N-[SACF]-x(2)-[FY]>
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