Analyse bioinformatique des séquences


Exercice avec PBIL : profils d'hydrophobicité


Connectez vous à http://pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_pcprof.html.

Copiez/collez la séquence suivante sans la ligne de commentaires

>gi 92 alpha-S1-casein
MKLLILTCLVAVALARPKHPIKHQGLPQEVLNENLLRFFVAPFPEVFGKEKVNELSKDIGSESTEDQAME
DIKQMEAESISSSEEIVPNSVEQKHIQKEDVPSERYLGYLEQLLRLKKYKVPQLEIVPNSAEERLHSMKE
GIHAQQKEPMIGVNQELAYFYPELFRQFYQLDAYPSGAWYYVPLGTQYTDAPSFSDIPNPIGSENSEKTT
MPLW


Soumettez la requête

Vous obtenez plusieurs profils d'hydrophobicité (H&W, K&D, K&S), ainsi qu'un profil d'antigénicité et enfin les régions transmembranaires (TM) potentielles.

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Document modifié, le 21 novembre, 2006