Analyse statistique du transcriptome

Utilisation de GeneANOVA: résultats

Le tableau de résultats obtenu en réalisant une ANOVA locale avec comme facteurs: gène et soufre est la suivant (NB: seules les premières lignes sont présentées mais en réalité le tableau complet de résultats fait 4107 lignes puisqu'il y a au départ 4107 gènes).

Légende:

Gène: chaque ligne correspond à un gène puisque l'on a choisi de faire une ANOVA locale, avec comme premier facteur le facteur gène.

Soufre: SCsoufre c'est à dire pour chaque gène, on regarde l'effet du facteur soufre(variabilité liée au soufre).

Résiduel: c'est la part résiduelle déduite par la formule: SC total= SC soufre+ SC jour+ SCrna +SC double + SC résiduelle

Total: SC totale de la ligne

F: c'est la valeur de F pour le facteur soufre c'est à dire le rapport SC soufre/SC résiduel. Les gènes les plus sensibles au soufre ont le F la plus élevée (signal/bruit le plus élevé).

p-value: probabilité d'obtenir la valeur F par hasard.

Variance: correspond ici à la variance cad SCsoufre/ddl

Normalisé: SC soufre/SC total c'est à dire la part du facteur soufre dans la variabilité totale.