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Analyse
bioinformatique des séquences
En savoir plus sur la banque TFD TFD est une base dédiée aux facteurs de transcription eucaryotes. Une partie des données a été extraite de GenBank et une autre partie provient de synthèses bibliographiques réalisées à partir de publications traitant de différents aspects de la transcription. La base est organisée en plusieurs fichiers permettant de regrouper différentes classes d'information que l'on connaît au niveau de la transcription. Ainsi la base renferme non seulement des données nucléiques mais aussi des informations sur les séquences protéiques directement impliquées dans la transcription comme les domaines protéiques interagissant avec l'ADN ou les cofacteurs de transcription. L'information la plus importante est bien sûr la liste des sites ou motifs nucléiques. Exemple : 
Un effort particulier a été réalisé pour spécifier à partir de quel promoteur ou de quel gène sont issus ces sites et pour établir s'il s'agit d'une séquence consensus ou d'une séquence actuellement unique, et pour donner la localisation relative du site d'initiation de la transcription (Ghosh et al., 1990 et Ghosh, 1993).
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