Analyse bioinformatique des séquences

4. - La manipulation des données

4.1 - Fonctions générales d'édition et de transfert

 

Edition de séquences

Les séquences peuvent se manipuler sur micro avec un éditeur spécialisé ou éventuellement avec un traitement de texte.

> Quelques exemples d'éditeurs spécialisés :
Editeur Macintosh DNA Aid+ ou DNA Strider.

> Exportation depuis Word :
Mettre en police non proportionnelle (Courier 10 par exemple) (sur une largeur de 15 à 17 cm) ce qui permet d'avoir le même nombre de caractères par ligne.
Sauvegarder avec le format d'enregistrement : Texte avec sauts de ligne

Transfert entre un micro et un serveur

> Utilisation de FTP : Avec un programme tel que Fetch 2.1 (sur un Mac connecté à Internet), il est très aisé de faire des transferts de fichiers, non seulement textes, mais aussi binaires (images, exécutables...). Pour les PC, vous trouverez l'équivalent avec par exemple le programme WS_FTP.

> Utilisation du couper/coller entre une fenêtre locale d'un traitement de texte (ou une fenêtre WWW) et une fenêtre Telnet (session interactive avec un serveur UNIX).

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Document modifié, le 14 décembre, 2006