Analyse bioinformatique des séquences

5. - La comparaison de séquences
5.3 - Le choix du matériel à comparer : ADN ou protéine ?
 

Une des questions qui se posent au biologiste lorsqu'il compare des séquences est de savoir sur quel matériel il doit travailler : ADN ou protéine ?

Concernant les acides nucléiques, pour les parties non codantes, on peut identifier des séquences homologues jusqu'à 200 millions d'années, 600 millions pour les régions codantes. Pour les protéines, on trouve des séquences homologues après 1 milliard d'années d'évolution et des similarités significatives au delà de 2,5 millions d'années.

En conclusion, dès que c'est possible, il est préférable de comparer les séquences au niveau protéique.