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Analyse
bioinformatique des séquences
S'exercer avec FASTA > Connectez vous à http://www.ebi.ac.uk/fasta33. > Copiez/collez la séquence suivante dans le cadre sans les lignes de commentaires : >sp P40460 YIO4_YEAST HYPOTHETICAL 80.5 KDA PROTEIN IN SLN1-RAD25 INTERGENIC REGION - Saccharomyces cerevisiae (Baker's yeast). MQSSTSTDQHVLHHMDPHRFTSQIPTATSSQLRRRNSTNQGLTDMINKSI ARNTISGTGIPTGGINKNKRTRSTVAGGTNGTALALNDKSNSRNSVSRLS INQLGSLQQHLSNRDPRPLRDKNFQSAIQEEIYDYLKKNKFDIETNHPIS IKFLKQPTQKGFIIIFKWLYLRLDPGYGFTKSIENEIYQILKNLRYPFLE SINKSQISAVGGSNWHKFLGMLHWMVRTNIKLDMCLNKVDRSLINQNTQE ITILSQPLKTLDEQDQRQERYELMVEKLLIDYFTESYKSFLKLEDNYEPS MQELKLGFEKFVHIINTDIANLQTQNDNLYEKYQEVMKISQKIKTTREKW KALKSDSNKYENYVNAMKQKSQEWPGKLEKMKSECELKEEEIKALQSNIS ELHKILRKKGISTEQFELQNQEREKLTRELDKINIQSDKLTSSIKSRKLE AEGIFKSLLDTLRQYDSSIQNLTRSRSQLGHNVNDSSLKINISENLLDRD FHEGISYEQLFPKGSGINESIKKSILKLNDEIQERIKTIEKDNITLEKDI KNLKHDINEKTQINEKLELELSEANSKFELSKQENERLLVAQRIEIEKME KKINDSNLLMKTKISDAEELVTSTELKLEELKVDLNRKRYKLHQQVIHVI DITSKFKINIQSSLENSENELGNVIEELRNLEFETEHNVTN > Sauvegardez les résultats dans p40460.fasta > Modification du ktup (rapidité/sensibilité) Comparer la même séquence et la même banque en utilisant ktup=1. Sauvegardez les résultats dans p40460.fasta1. Comparez les résultats entre ktup =2 (valeur par défaut : fichier p40460.fasta) et ktup=1(fichier p40460.fasta1). |
