Analyse bioinformatique des séquences


S'exercer avec GRAIL


Connectez vous à http://grail.lsd.ornl.gov/grailexp/.

Dans 'Perform Analysis', choisissez comme 'organism' Arabidospsis thaliana.

Indiquez ensuite quelles sont les informations que vous souhaitez obtenir. Ici nous choisirons 'Genes (utilizing Database Homology Search)' et 'Repetitive Element'.

Copiez/collez la séquence suivante dans le cadre sans les lignes de commentaires :

>gi 940369 gb U23482.1 ATU23482 Arabidopsis thaliana 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase (ACS4) gene, complete cds GTTACTTTTCAAATCTTCCCTCATATTATATAGCCATTGATATCATAGAGGATGTGAGTTTTAACTTAAT ATTTACCCGTTTGAAACTAGCTATTTACTTAAATATGAATTATAATCTAGTTTAACTACCAAAAACATC A TATGGGGACAAGAAAAAGTAATAAAACGTATGGAAAATTTTGTAGATGTTATAAATGGATAATTATTC AA GTGATAATCTATCACTTTGATCTTATCTCTTTATCCAATTTAATTACTTTGTCTCTAAGTGATTTGCTTC CAAAATCTAAGTGTAGTCTATCCTATTTCTATCTTATCCTATCATATAATCTTCTATATATATGTGAGTC CGATGTTGTAAAGCGTACGAGAGAGAGTAATGAAGAGTGAAGTGTTATATTGTTCTCTCGTCCACTTC CA CTCTCTCTTTTATCTCTTACTTACTTCTTCGTAAGATCATTACATATAATAAATAATATTATTTATGTTT GTGTTATATTTAATAACAGTAAAAAGTTTTAAAACGTTGAAAAAATTAGCCGACATAGAATACAAAAG AG GGTTAGCATCGGGGGAGAAACGTGGACCAACATGATACACCCTCCAAAATAGTCCCCAAGTTGAAAC ATT GACATGTTTCGCTTTTTCTTTTCTGTGTATACTTTTTTTTTCTGTGGGTCACATTATTTAATATTTGTAT ACAAGCAGCTATTTTACATGGAGATTTCCTGTCGGTATAGCGTCCTCATTTCTCCATCGCTTCCACTTTT TTCCTATACTAATTTGATCTAATTAATTCATATGTCAAAACATTAAGAAAATGAAACTCGTAATTCATA C TTGAATTTAATAGATTAATTAAAATGCTATTTATTGGCAAAATAAACTCGGTTTATATCTAAATTTTAG A ATCACTAAAACTTTTTGCCCAAAAAAAAATAAAAATAAATCACTAAAACAAAAAACAATCAAAAGAA AAC CCATGTTGGTAAATCGGATAATGAAAATAATTAGAATCCCCGTCCTTTGTGTATTTTGGCGTAGCATGA A ACTATATAATAAACATGCATTCATTCTTAGACTTCTCGTAGCTTATCAACAACAACGCGCTCGATCTCT C TCAGCCTGTCTGACAACTCTTTCTCTAGTTCTAGAGTTTTCAATTTATTGTTGAGCCTTTTATTAAAAAA AAAAAAACAAGAACAAAAGAAATGGTTCAATTGTCAAGAAAAGCTACATGCAACAGCCATGGCCAAG TCT CTTCGTATTTCCTTGGTTGGGAAGAGTACGAGAAGAATCCTTACGACGTTACCAAGAACCCTCAAGGC AT TATCCAGATGGGTCTTGCGGAAAATCAGGTAAACAAATATTATTCAACAGCATGTGATATATATATAC TT ATGTATATCATGACAGAGAGACTAATTTAAAGTATGTTTAATTTTATTGGATTTCTGTAGCTATGCTTT G ATCTACTAGAGTCATGGCTTGCACAAAACACAGACGCAGCCTGTTTCAAGAGAGATGGCCAGTCTGTT TT CCGGGAACTCGCTCTCTTTCAAGACTACCATGGCCTCTCTTCCTTCAAAAATGTAAGATTATTAATTGT A TTTATCAAATTTATTTGTAGGTTGCTGATCTTGCTCGAATGATTTTCAGGCCTTTGCTGATTTCATGTCA GAAAATAGAGGAAATCGAGTTTCTTTTGATTCAAACAACCTTGTGCTCACTGCTGGAGCCACTTCCGC AA ACGAGACTCTAATGTTTTGTCTTGCAGATCCCGGTGACGCTTTCTTGCTTCCCACGCCATATTATCCAG G GTTAGTCCACTGTTTGCTTACACGTAAAATTTCCATCATTCCTACGAACTTGACTTAACTAAAACTCAT G TTTATTTTTGTACTTCAGGTTTGATAGGGATCTAAAATGGCGAACCGGGGTTGAGATTGTACCAATCCA A AGCTCAAGTACTAACGGGTTTCGCATAACGAAACTTGCACTCGAAGAAGCCTACGAGCAAGCCAAGA AGC TTGACCTAAACGTCAAAGGAATACTCATCACCAACCCATCTAACCCTTTGGGTACGACAACAACCCAA AC CGAACTCAACATTCTATTTGATTTCATCACCAAGAATAAGAATATACATTTAGTAAGTGACGAGATAT AT TCGGGCACAGTATTCAACTCTTCAGAATTCATCAGCGTCATGGAGATTCTAAAAAATAATCAACTCGA AA ACACCGATGTTTTGAACCGAGTCCACATTGTTTGTAGCTTATCTAAAGATCTAGGCCTCCCTGGTTTTA G AGTTGGAGCCATTTACTCCAATGACAAAGATGTCATCTCTGCCGCTACAAAAATGTCAAGTTTCGGCCT T GTCTCCTCCCAGACACAATACCTACTATCCTCATTATTATCTGACAAGAAGTTCACTAAGAACTACCTT A GAGAGAACCAAAAACGGCTCAAGAACAGACAGAGAAAGCTCGTGTTGGGTCTAGAGGCCATCGGGAT CAA ATGTCTGAAGAGTAATGCGGGACTCTTTTGTTGGGTCGACATGAGACCTCTCCTTAGATCTAAAACGTT C GAAGCGGAAATGGATCTTTGGAAGAAGATTGTTTACGAAGTGAAGCTCAACATCTCTCCTGGTTCGTC GT GCCATTGTGAAGAACCGGGTTGGTTTAGAGTTTGTTTCGCGAACATGATTGATGAGACATTAAAGCTT GC TTTAAAGAGATTGAAGATGTTGGTTGATGATGAAAACTCAAGTAGAAGATGCCAAAAGAGTAAAAGC GAA AGACTAAACGGTTCGAGGAAGAAGACGATGTCAAATGTCTCTAACTGGGTTTTCCGACTATCGTTTCA CG ACCGTGAGGCTGAGGAACGATAGTCCGGTTTTTGTTTTGAAGTTCTTTTTTTTTGTTTCCCACACATTGC AAGTGATTCTGTAATTTTTTTTATCACGAGAGAGAGTGTAAAAAAATGGAAATGCAACGTGCTTACTC TG ATCCTAGATTTTAGAAAACCGTTGAAGACTTCTTAGAGCAAGTCCATCGGCAGTTTTTAATGGGTTTCT A ATGGGTTTCTAGCTAATTAAAAGTCCAAAATTAAATGAAAACCCAACTAAATAATTAGGATCCATCCC AA TATTAGGTTTTTTGGATGGGTTTTTAGACGGCGACGTGGTCGACTGTGAGTCGTCGGAAAACAAAAAA AA TCACAACACTCATGTTTTCCTTTTTCCTCTCGTTTTTCACTTTTTTGTTTTGTCCGACGGCCGGCGATTC GAATCGATTTGATCTCCGGTGTATCGAACATGAAATCGGGAGAGAAGAGCCAAATCATCGACGACTTG GT TCACCAATTCCATTCTTCGAACCATACTCATATAAGAGTTTCTTGGCTTCTCTCTAAAACTCTTCTAATT TTCTGATA


8 janvier, 2008nt>

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Document modifié, le 21 novembre, 2006