Analyse bioinformatique des séquences


S'exercer avec PATTERNn


Connectez vous à http://bioinfo.hku.hk/services/analyseq/cgi-bin/patternn_in.pl.

Recherchez le motif TATAAT (TATAbox).

Copiez/collez la séquence suivante dans le cadre sans la ligne de commentaires :

>gi 91 emb X59856 BTAS1C B.taurus gene for alpha-S1-casein GATCTTCCCAACCCAGATGGGCATGAAAAAGGAGAGAAATAAAAAGGACTTAACAGAAGCAGAAGAAATT AAGAAGAGGTGGCAAGAATAGTATTACAGAAGAACTGTATTTAAAGATCTTAATGACCCAGATAGCCACA GTTGTGTAGTCTCTCATCTACAGCTTAAAACTCAATGTTCAAAAAACTAAGTTCATAGCATACTGCCCCA TCACTTCATGGAAAATAGTGGGGGAGGGGGAGAAGGTGGAAGTAGTGTCAGATTTTATTTTCTTGGACTC AAAATCACTGCAGACAGTGATTATAGCCATGAAATTAAATGACGCTTACTCCTTGAAAAGAAAGTTCTGA AAAACCTAGACAACATATTAAAAAGCAGTGACATCACTTTACTGATAAGTGTCTTNATAGTCAAAGCTAT GGTTTTTCCAGTAGCCATGTACAGATGTGAGAATTGGACTATGAAGAAGGATGAGTGTCAAAGGACTGAT GTTTTCAAATTGTGGTGGATACACTCCTTTGCATGCGTGCTAAGTCATTTCAGTCATGTCCAACTCTTTG CAACCCAGTGGACTGTCGTCTGCCAGGTTCCTCTGTCCATGGGATTCTCCAGGCAAGAGCAACGGAGTGG GTTGTCATTTCCTCCACCAGGGGATCTTCCCAATCCAGATATTGAACCTGCATCTCTAATGTTTCCTGCA TTGGCAGGCAGGTTCTTTACCACTAGTGCCACCTGGAAAGTCCGGATTACACTCCTGGGAAAGACAAAAG TAGAGTATTACAATGCAGCAAGGATTTTTGTTCTCAGCTCCTTGAATAAATTATAGTGAATAGAAAACAT TAGTATCTTGTTGAAATTGATGTGAAACAGATAGTAAGGAAGATAATATCTAAAGAAAACTTCAATATGG 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La présence d'un motif de type TATA box peut être un argument important pour conclure sur la présence d'un promoteur et donc du début d'un gène.

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Document modifié, le 21 novembre, 2006