Analyse
bioinformatique des séquences
S'exercer avec PATTERNn > Connectez vous à http://bioinfo.hku.hk/services/analyseq/cgi-bin/patternn_in.pl. > Recherchez le motif TATAAT (TATAbox). > Copiez/collez la séquence suivante dans le cadre sans la ligne de commentaires : >gi 91 emb X59856 BTAS1C B.taurus gene for alpha-S1-casein GATCTTCCCAACCCAGATGGGCATGAAAAAGGAGAGAAATAAAAAGGACTTAACAGAAGCAGAAGAAATT AAGAAGAGGTGGCAAGAATAGTATTACAGAAGAACTGTATTTAAAGATCTTAATGACCCAGATAGCCACA GTTGTGTAGTCTCTCATCTACAGCTTAAAACTCAATGTTCAAAAAACTAAGTTCATAGCATACTGCCCCA TCACTTCATGGAAAATAGTGGGGGAGGGGGAGAAGGTGGAAGTAGTGTCAGATTTTATTTTCTTGGACTC AAAATCACTGCAGACAGTGATTATAGCCATGAAATTAAATGACGCTTACTCCTTGAAAAGAAAGTTCTGA AAAACCTAGACAACATATTAAAAAGCAGTGACATCACTTTACTGATAAGTGTCTTNATAGTCAAAGCTAT GGTTTTTCCAGTAGCCATGTACAGATGTGAGAATTGGACTATGAAGAAGGATGAGTGTCAAAGGACTGAT GTTTTCAAATTGTGGTGGATACACTCCTTTGCATGCGTGCTAAGTCATTTCAGTCATGTCCAACTCTTTG CAACCCAGTGGACTGTCGTCTGCCAGGTTCCTCTGTCCATGGGATTCTCCAGGCAAGAGCAACGGAGTGG GTTGTCATTTCCTCCACCAGGGGATCTTCCCAATCCAGATATTGAACCTGCATCTCTAATGTTTCCTGCA 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La présence d'un motif de type TATA box peut être un argument important pour conclure sur la présence d'un promoteur et donc du début d'un gène. |