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Analyse
bioinformatique des séquences
Exercice avec Blocksearcher > Connectez vous à http://blocks.fhcrc.org/blocks/blocks_search.html > Copiez/collez la séquence suivante au format FASTA: >sp|P26690|6DCS_SOYBN NAD(P)H DEPENDENT 6'-DEOXYCHALCONE SYNTHASE (EC 1.-.-.- ) - Glycine max (Soybean). MAAAIEIPTIVFPNSSAQQRMPVVGMGSAPDFTCKKDTKEAIIEAVKQGY RHFDTAAAYGSEQALGEALKEAIHLGLVSRQDLFVTSKLWVTENHPHLVL PALRKSLKTLQLEYLDLYLIHWPLSSQPGKFSFPIEVEDLLPFDVKGVWE SMEECQKLGLTKAIGVSNFSVKKLQNLLSVATIRPVVDQVEMNLAWQQKK LREFCKENGIIVTAFSPLRKGASRGPNEVMENDVLKEIAEAHGKSIAQVS LRWLYEQGVTFVPKSYDKERMNQNLHIFDWALTEQDHHKISQISQSRLIS GPTKPQLADLWDDQI > Recherchez les blocks contenus dans la séquence de Glycine max en gardant les paramètres par défaut. Attention les résultats peuvent être un peu longs à obtenir. > Vous trouverez un alignement très significatif avec un bloc de la banque. Ce bloc correspond à la signature de la famille des aldo/keto reductases. |
