Les sondes simple brin
-
d'ADN :

> sondes à activité spécifique importante (Southern, Northern Blot)

> protection contre la nucléase S1, hybridation
in situ.

Avantage : ne se renature pas sur elle-même lors de l'hybridation.
-
d'ARN : ribosondes.

> rendements d'hybridation meilleurs par rapport aux hybrides ADN-ADN

et plus stables

> pour hybridation
in situ

> cartographie des ARN
Attention :
Les sondes radioactives présentent de nombreux inconvénients :
- nécessité de se protéger du rayonnement émis = un maniement des sondes inconfortable.
- décroissance rapide du P32 ce qui nécessite un besoin de marquer les sondes fréquemment.
Pour pallier à ces inconvénients, on peut utiliser les sondes 'froides'.