Notion d'enzymes compatibles

Deux enzymes de restriction sont dites compatibles quand elles génèrent après digestion des fractions aux extrémités cohésives complémentaires. Ces fragments peuvent être facilement ligaturés.

Exemple : Les enzymes Bam HI (G / GATCC) et Mbo I ( / GATC):
 
Figures ci-dessous : © Faculté de Médecine de la Grange Blanche - Lyon
 
Action de Bam HI:
 

 
Action de Mbo I:
 

Ligatures possibles : 1+4 et 2+3.