Les cartes d'hybrides de radiation (RH)

La carte RH repose sur la fréquence de cassures chromosomiques induites artificiellement, observées chez des hybrides d'irradiation (cellules humaines lourdement irradiées et fusionnées à des cellules de hamster) : deux marqueurs initialement localisés à proximité l'un de l'autre ont plus de chance d'être simultanément retrouvés dans les mêmes hybrides que deux marqueurs éloignés. Les distances se mesurent en centiray (cR).

Les étapes de la cartographie d'hybridation

• Des marqueurs provenant de la carte génétique (dont on connaît la localisation) vont définir un cadre (repères) sur la carte : ils sont testés par PCR sur chaque hybride, de façon à établir lesquels les contiennent.
• Tout nouveau marqueur (par exemple, gène ou EST) est ensuite localisé par rapport à un marqueur-cadre : la distance entre deux marqueurs sera d'autant plus faible que le nombre d'hybrides simultanément positifs pour ces deux marqueurs (et donc les contenant) sera important.
  

La dose d'irradiation (rayons X) appliquée aux cellules humaines va conditionner la résolution de la carte :

• Des doses élevées vont induire des cassures chromosomiques fréquentes : elles sont utilisées pour ordonner des marqueurs proches et donc permettront de produire des cartes à haute résolution.
• A l'inverse, des faibles doses permettront d'ordonner des marqueurs plus éloignés (statistiquement plus faciles à séparer) et produisent des cartes à résolution moins fine.
  

Illustration de la construction d'une carte RH :

© INRA

Pour en savoir plus sur les cartes de liaison et leurs utilisations chez les végétaux :
http://www.pierroton.inra.fr/genetics/cartoqtl/cartoqtl.html