Profils physico-chimiques de la protéine.

Utilisez le logiciel Protscale proposé sur le site expasy (http://www.expasy.org/cgi-bin/protscale.pl ) pour établir le profil d’hydrophobicité selon la méthode de Kyte et Doolittle de la séquence inconnu.prot.

Afin de vous aider à interpréter vos résultats, nous vous donnons les résultats que l’on obtient par le même logiciel sur la séquence P32011 qui est une protéine transmembranaire (6 domaines transmembranaires :58-78,85-105,150-170,171-191,198-218,252-272) et la séquence P26612 qui est cytoplasmique. Ces deux exemples sont tirés d’organismes procaryotes.

Comparez les profils entre votre séquence et les deux autres et concluez si possible quand à la nature de votre protéine.

Point4 :

Notez vos conclusions sur votre cahier d’expérience. Lorsque vous avez terminé, vous pouvez consulter notre commentaire afin de vérifier le bon déroulement de votre réflexion.

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Document modifié le 8 janvier, 2008