Exercises de bio-informatique

II. Recherche de similitude par comparaison aux banques de données généralistes internationales

Utilisation de Blast

Comparez votre séquence inconnu.prot, avec la banque nr en utilisant le programme blastP  (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/). Répondez aux questions suivantes en notant bien vos conclusions sur votre cahier d'expérience.

  • La séquence inconnu.prot existe-t-elle déjà dans une banque ?
  • Y-a-t-il des séquences similaires dans les banques ?
  • Trouve-t-on un alignement significatif avec une/des protéines?

     

    Chez des eucaryotes ?

    Chez des procaryotes ?

    © Université de TOURS - GÉNET
    Document modifié le 9 septembre, 2005