Exercices de bio-informatique

Nous proposons dans cette partie, deux exercices « tutorés » afin de vous familiariser avec la démarche d'analyse de séquences et l'emploi des différents logiciels dans ce domaine. Tout au long des exercices vous serez mis en situation d'un chercheur confronté à de nouvelles séquences dont il va falloir dégager un maximum d'informations. Le premier exercice concerne l'analyse d'une séquence nucléotide telle qu'un chercheur peut l'obtenir à la sortie d'une étape de séquençage en laboratoire. Le second exercice concerne l'analyse d'une protéine dite « hypothétique », c'est à dire issue de la traduction automatique d'une phase de lecture potentielle après analyse d'une séquence nucléotidique.

Le but de ces exercices est d'utiliser un certain nombre de logiciels disponibles sur des sites Internet afin de répondre aux nombreuses questions que l'on peut se poser sur ces séquences.

Afin de vous mettre réellement en situation, il est indispensable que vous ayez à portée de main un cahier d'expérience dans lequel vous noterez les principaux résultats et surtout les réponses aux questions qui vous seront posées tout au long des exercices.Pour certaines questions vous aurez la possibilité de lire les commentaires en ligne, et si vous souhaitez les conserver, de les télécharger en cliquant sur l'icone placée dans le texte.

Maintenant à vous de travailler !

Exercice 1 : Analyse d'une séquence nucléotique inconnue

Exercice 2 : Analyse d'une séquence de protéine hypothétique

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