Analyse bioinformatique des séquences

Tableau I.
Étapes-clés dans l'histoire de la bioinformatique

1951 Première séquence protéique (Insuline, Sanger)
1960 Lien entre séquence & structure (Globines, Perutz)
1965 Premier Ordinateurs IBM/360
1965 "Evolutionary divergence and convergence in Proteins" (Zuckerkandl & Pauling)
1967 "Construction of Phylogenetic Trees" Fitch & Margoliash.
1968 Atlas of Protein Sequences (M. Dayhoff, Georgetown)
1968 mini-ordinateur DEC PDP-8
1970 "A general method applicable to the search for similaries in sequences of two proteins" (Needleman & Wunsch).
1971 Premier travaux sur le repliement des ARNs (J. Ninio)
1972 Premier microprocesseur Intel 8008
1973 "Génie Génétique" (Cohen et al.)
1974 "Prediction of Protein Conformation" (Chou & Fasman)
1975 Intel 8080, kit Altair
1977 mini-ordinateur DEC-VAX.
1977 Micro-ordinateurs (Apple, Commodore, Radioshack
1977 Séquençage d'ADN (Sanger, Maxam, Gilbert)
1977 Premier "package" Bioinformatique (Staden)
1978 Bases de données: ACNUC, PIR, EMBL, GenBank
1980 Accès téléphonique à la base de données PIR
1981 IBM-PC (8088), 16-32kb
1981 Los Alamos-GenBank: 270 séquences, 370.000 nucléotides
1981 Programme d'alignement local (Smith-Waterman)
1983 IBM-XT Disque DUR (10 Mbytes)
1984 MacIntosh : interface graphique & souris
1985-88 Programme "Fasta" (Pearson-Lipman)
1989 INTERNET succède à ARPANET et BITNET
1990 Programme "Blast" (Altschul et al.)
1990 Clonage positionnel et séquençage de NF-1
1991 "Grail", programme performant pour localiser les gènes (Mural et al.)
1991 Étiquettes d'ADNc "EST" (Venter et al., Matsubara et al.)
1992 Séquençage complet du chromosome III de levure
1995 Première séquence complète d'un micro-organisme (Venter et al.; H. influenza)
1996 Séquence complète de la levure (consortium européen)
1997 Programme "Gapped Blast" (Alschul et al.)
1997 11 génomes bactériens disponibles
1998 2 Mbase/jour de nouvelles séquences publiques
2001 Séquence ("premier jet") complète du génome humain (?)