Analyse
bioinformatique des séquences
1. - Introduction
1.1 - Historique et situation française
Le terme de 'Bioinformatics'
n'est apparu dans la littérature scientifique qu'au tout
début des années 90. Cependant, ce domaine de recherche
ne vient pas d'émerger. Bien avant que cette discipline ne
soit mise sous les feux de la rampe par l'essor de la génomique,
quelques dizaines de laboratoires dans le monde travaillaient depuis
longtemps en 'biomathématique', une discipline constituée
pour répondre aux besoins précoces (dès 1965
!) de la phylogénie moléculaire.
Le tableau I
retrace les grandes étapes de la bioinformatique, et montre
à quel point cette discipline a accompagné et souvent
précédé le développement des concepts
biologiques et des outils informatiques sur laquelle elle est fondée.
Une partie du retard pris en Europe continentale
(et en France) dans ce domaine (la bioinformatique, publique ou
privée, est à 90% anglo-saxonne) peut être attribué
à une méconnaissance de l'origine et de l'histoire
déjà longue des biomathématiques, et à
la confusion associée au nouveau terme de 'Bioinformatique'.
Les quelques actions en faveur de cette discipline ont été
exercées dans un contexte multidisciplinaire Informatique/Biologie,
qui n'a jamais collé à la réalité d'un
domaine de recherche déjà bien structuré autour
de concepts et techniques spécifiques.