Analyse
bioinformatique des séquences
5. - La comparaison de séquences
5.5 - Les principaux logiciels et programmes de comparaison
avec les banques
de séquences
5.5.4 - Généralités sur les paramètres des logiciels de comparaison de séquences
1.
La pondération des substitutions
- Séquences d'ADN
- Séquences protéiques : les matrices
> Les matrices protéiques liées à l'évolution
> Les matrices protéiques liées aux caractéristiques physico-chimiques
> Le choix d'une matrice protéique
2.
La pondération des gaps