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Analyse
bioinformatique des séquences
S'exercer avec BLAST > Connectez vous à http://www.ncbi.nlm.nih.gov puis cliquez sur le bouton BLAST. > Choisissez Advanced BLAST Search dans la rubrique BLAST 2.1. > Copiez/collez la séquence suivante dans le cadre : >sp P39706 YAH3_YEAST HYPOTHETICAL 48.7 KDA TRP-ASP REPEATS CONTAINING PROTEIN IN TFC3-RFA1 INTERGENIC REGION - Saccharomyces cerevisiae (Baker's yeast). MNILLQDPFAVLKEHPEKLTHTIENPLRTECLQFSPCGDYLALGCANGAL VIYDMDTFRPICVPGNMLGAHVRPITSIAWSPDGRLLLTSSRDWSIKLWD LSKPSKPLKEIRFDSPIWGCQWLDAKRRLCVATIFEESDAYVIDFSNDPV ASLLSKSDEKQLSSTPDHGYVLVCTVHTKHPNIIIVGTSKGWLDFYKFHS LYQTECIHSLKITSSNIKHLIVSQNGERLAINCSDRTIRQYEISIDDENS AVELTLEHKYQDVINKLQWNCILFSNNTAEYLVASTHGSSAHELYIWETT SGTLVRVLEGAEEELIDINWDFYSMSIVSNGFESGNVYVWSVVIPPKWSA LAPDFEEVEENVDYLEKEDEFDEVDEAEQQQGLEQEEEIAIDLRTREQYD VRGNNLLVERFTIPTDYTRIIKMQSS > Comparez avec BlastP la séquence P39706 à la banque Swiss-Prot en laissant les paramètres par défaut. > Sauvegardez les résultats dans P39706.blosum62 > Refaites la même comparaison en utilisant cette fois la matrice PAM30 et les coûts de gap recommandés avec cette matrice. Sauvegardez les résultats dans P39706.pam30 et comparez les résultats avec P39706.blosum62. |
