Exercises de bio-informatique

Réalisation

1/Amplification du gène d’intérêt

Pour réaliser l’amplification d’un fragment d’ADN, (içi un fragment d'actine), vous utiliserez classiquement la technique de PCR. Pour plus d’informations sur la théorie de la PCR : cliquez ici. Plusieurs critères doivent être définis par l’utilisateur afin de réaliser cette PCR.

1.1 Détermination des amorces
Afin de vous aider dans votre choix d’amorces , vous disposez des informations suivantes :

- les gènes d’actine sont des gènes hautement conservés entre espèces proches comme par exemple au sein des insectes.
- Vous pouvez consulter la banque Genbank (banque de séquences nucléiques) à l’adresse suivante : GENBANK
- Vous disposez des logiciels CONVSEQ(formatage de fichier de séquences) et ClustalW (alignement multiple de séquences).

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