a/ Genbank (nucleotide) : une recherche à partir de mots clefs comme : actin-gene-insecta-complete permet de récupérer un ensemble de séquence de gènes d’actine chez les insectes.
b/Sélection d’un certain nombre de séquences dont la taille est proche afin de favoriser un alignement multiple de bonne qualité. Ici on se base sur une taille avoisinant les 1500nt.
Résultat : 8 séquences peuvent servir de point de départ.
C/ Préparation du fichier multiple de séquences au format Fasta en utilisant le logiciel de formatage CONVSEQ.
Résultat : fichier actin_multiple_court

2/ Préparation de la séquence consensus

Réalisation d’un alignement multiple en utilisant le logiciel clustalW sur le fichier multiple de séquences déterminé précédemment.
Résultat : Clustal_resultat_court

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Document modifié le 17 juillet, 2017