III. Recherche de similarité par comparaison de la séquence avec les banques
généralistes internationales (Utilisation de Blast/Fasta)
Deux logiciels peuvent être utilisés dans ce type d'analyse. Il s'agit de
Blast et Fasta. Chacun possède ses spécificités
et il est conseillé sauf en cas de réponse évidente de prendre le temps d'effectuer
les deux types de comparaison.
Utilisation de Blast : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
Comparez la séquence inconnu.tfa et la banque nr
avec le logiciel Blastn.
NB : Vous noterez soigneusement les réponses aux questions qui vous sont
posées sur votre cahier d'expérience.
Chez des eucaryotes ? Chez des procaryotes ? |
© Université
de TOURS - GÉNET
Document modifié le 9 septembre, 2005