Exercises de bio-informatique

1.2 Calcul des conditions de réaction

Après avoir déterminé le meilleur couple d’amorces, il reste à déterminer la température à laquelle va s’effectuer la réaction de PCR: Thybridation. Estimez cette température d’hybridation pour votre couple d’amorce.

Résultat : point2


NB : d’autres critères sont importants pour optimiser une PCR, comme par exemple les concentrations en certains ions. Pour plus d’informations vous pouvez consulter : pcr

1.3 Contrôle de la PCR

Avant de passer à l'estimation de la quantité d'ADN d'actine obtenu à la fin de la PCR, il est recommandé de tester la taille du fragment amplifié, ainsi que plusieurs conditions de réactions (température et concentration en MgCl2). Pour cela nous vous proposons plusieurs gels. Le fragment obtenu à l'issu de la PCR est d'environ 1100 pb, ce qui est cohérent avec les amorces A et D retenues.

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