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| Nom | Orientation | Positions dans alignement | Taille(nt) | Séquence simplifiée | Séquence ammorce |
| A | 5'->3' | 19 | Entière | ATGTG{ct}GACGA{acgt}G A{agt}GT{gt}{tg} |
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| B | 5'->3' | 20 | Entière | TC{ct}GG{cat}ATGTGCAA {ga}GCCGG |
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| C | 5'->3' | 20 | Entière | GGGCG{cga}GA{tc}TC{ga} TCGTACTC |
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| D | 5'->3' | 19 | Entière | AGAA{ag}CACTT{gc}C{gt} G{gt}G{ag}AT |
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| Ebis | 5'->3' | 20 | Fragment | GA{ct}ATGGAGAAGATCT GGCA |
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| F | 5'->3' | 17 | Fragment | TAGCA{cg}AGCTTCTCCTT | |
| G | 5'->3' | 21 | Fragment | GTGGCCAT{ct}TCCTG{tc} TC{ag}AAG |
Rq : la notation {at} indique une dégénérescence de l’amorce avec soit A soit T à cette position dans l’alignement.
En utilisant le logiciel Netprimer déterminez selon vous le meilleur couple en fonction des critères rappelés précédemment.
N’oubliez pas de noter soigneusement toutes vos réponses sur votre cahier d’expérience.
Pour vous guider à la fin de votre réflexion, vous pouvez consulter les résultats : Point1
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Document modifié le
17 juillet, 2017