VI. Alignement multiple avec d'autres protéines de la même famille

1/Préparation du fichier multiple de séquence

A/ Les résultats de comparaison de séquences (Blastp), permettent de sélectionner les 12 séquences avec lesquelles inconnu.prot présente une ressemblance largement significative. En utilisant le logiciel READSEQ , créez un fichier multiple de 12 séquences contenant au format clustal les séquences suivantes sw :P37699 ; sw :P37701 ; sw :P04955 ; sw : P19254 ; sw :P29019 ; pdbseq :1CEM_ ; pdbseq :1KWF_A ; gp :AF334682 ; gp :AB051575 ; gp :AB059267 ; gp :AB006819 ; refseqgp : NP_656550 ;  Enregistrez ce fichier au format texte avec saut de lignes sous le nom de multi.txt.

B/ Copier/coller dans ce même fichier multi.txt la séquence supplémentaire : inconnu.prot

Si vous rencontrez des difficultés à construire votre fichier de séquences, vous pouvez le récupérez directement en cliquant içi.

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Document modifié le 28 juin, 2010